Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd9P40240 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd9P40240 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd9P40240 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd9P40240 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd9P40240 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd9P40240 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd9P40240 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd9P40240 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd9P40240 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cd9P40240 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd9P40240 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd9P40240 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd9P40240 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms