Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik2P39087 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Grik2P39087 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik2P39087 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik2P39087 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik2P39087 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik2P39087 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik2P39087 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms