Protein–RNA interactions for Protein: P33534

Oprk1, Kappa-type opioid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oprk1P33534 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Oprk1P33534 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Oprk1P33534 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Oprk1P33534 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Oprk1P33534 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Oprk1P33534 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Oprk1P33534 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Oprk1P33534 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Oprk1P33534 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Oprk1P33534 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Oprk1P33534 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Oprk1P33534 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Oprk1P33534 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Oprk1P33534 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Oprk1P33534 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Oprk1P33534 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms