Protein–RNA interactions for Protein: P32020

Scp2, Non-specific lipid-transfer protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2P32020 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scp2P32020 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scp2P32020 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scp2P32020 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scp2P32020 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scp2P32020 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scp2P32020 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scp2P32020 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scp2P32020 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scp2P32020 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scp2P32020 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scp2P32020 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scp2P32020 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scp2P32020 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scp2P32020 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scp2P32020 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scp2P32020 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scp2P32020 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scp2P32020 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scp2P32020 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scp2P32020 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scp2P32020 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scp2P32020 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Scp2P32020 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms