Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa5P28312 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa5P28312 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa5P28312 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa5P28312 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa5P28312 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa5P28312 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms