Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb3P28231 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjb3P28231 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms