Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde6aP27664 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde6aP27664 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms