Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra2P26048 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gabra2P26048 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra2P26048 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms