Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfkb1P25799 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfkb1P25799 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms