Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clk1P22518 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clk1P22518 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clk1P22518 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clk1P22518 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clk1P22518 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clk1P22518 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clk1P22518 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clk1P22518 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clk1P22518 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clk1P22518 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clk1P22518 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clk1P22518 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms