Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Myo5bP21271 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Myo5bP21271 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo5bP21271 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo5bP21271 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo5bP21271 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo5bP21271 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo5bP21271 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myo5bP21271 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myo5bP21271 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myo5bP21271 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myo5bP21271 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myo5bP21271 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myo5bP21271 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myo5bP21271 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myo5bP21271 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Myo5bP21271 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myo5bP21271 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myo5bP21271 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms