Protein–RNA interactions for Protein: P18406

Cyr61, Protein CYR61, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyr61P18406 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyr61P18406 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyr61P18406 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyr61P18406 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyr61P18406 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyr61P18406 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyr61P18406 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyr61P18406 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyr61P18406 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyr61P18406 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyr61P18406 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyr61P18406 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyr61P18406 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyr61P18406 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyr61P18406 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyr61P18406 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyr61P18406 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cyr61P18406 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyr61P18406 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyr61P18406 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyr61P18406 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyr61P18406 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyr61P18406 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyr61P18406 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyr61P18406 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyr61P18406 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyr61P18406 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyr61P18406 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms