Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb1P17919 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms