Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spi1P17433 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spi1P17433 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spi1P17433 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spi1P17433 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spi1P17433 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spi1P17433 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spi1P17433 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms