Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcna1P16388 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kcna1P16388 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms