Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irf1P15314 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf1P15314 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf1P15314 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irf1P15314 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irf1P15314 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Irf1P15314 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irf1P15314 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irf1P15314 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irf1P15314 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irf1P15314 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irf1P15314 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Irf1P15314 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irf1P15314 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irf1P15314 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irf1P15314 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irf1P15314 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irf1P15314 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irf1P15314 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irf1P15314 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irf1P15314 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1245.6 ms