Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RaraP11416 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RaraP11416 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RaraP11416 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RaraP11416 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RaraP11416 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RaraP11416 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RaraP11416 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RaraP11416 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RaraP11416 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RaraP11416 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RaraP11416 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RaraP11416 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RaraP11416 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RaraP11416 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RaraP11416 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RaraP11416 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RaraP11416 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RaraP11416 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RaraP11416 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RaraP11416 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RaraP11416 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RaraP11416 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RaraP11416 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RaraP11416 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RaraP11416 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RaraP11416 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RaraP11416 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RaraP11416 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RaraP11416 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RaraP11416 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RaraP11416 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RaraP11416 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RaraP11416 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RaraP11416 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RaraP11416 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RaraP11416 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RaraP11416 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RaraP11416 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RaraP11416 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RaraP11416 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RaraP11416 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RaraP11416 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RaraP11416 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RaraP11416 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RaraP11416 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RaraP11416 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RaraP11416 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RaraP11416 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RaraP11416 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RaraP11416 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RaraP11416 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RaraP11416 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RaraP11416 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RaraP11416 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RaraP11416 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RaraP11416 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RaraP11416 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RaraP11416 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RaraP11416 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RaraP11416 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RaraP11416 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RaraP11416 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RaraP11416 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RaraP11416 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RaraP11416 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RaraP11416 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RaraP11416 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RaraP11416 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RaraP11416 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RaraP11416 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RaraP11416 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RaraP11416 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RaraP11416 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RaraP11416 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RaraP11416 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RaraP11416 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RaraP11416 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RaraP11416 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RaraP11416 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RaraP11416 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RaraP11416 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RaraP11416 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RaraP11416 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RaraP11416 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RaraP11416 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RaraP11416 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RaraP11416 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RaraP11416 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RaraP11416 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RaraP11416 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RaraP11416 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RaraP11416 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RaraP11416 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RaraP11416 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RaraP11416 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RaraP11416 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RaraP11416 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RaraP11416 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RaraP11416 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms