Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lire1P11260 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lire1P11260 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lire1P11260 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lire1P11260 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lire1P11260 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lire1P11260 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lire1P11260 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lire1P11260 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lire1P11260 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lire1P11260 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lire1P11260 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms