Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myod1P10085 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myod1P10085 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myod1P10085 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myod1P10085 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myod1P10085 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myod1P10085 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myod1P10085 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myod1P10085 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myod1P10085 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myod1P10085 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms