Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgamP05555 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgamP05555 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgamP05555 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgamP05555 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgamP05555 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgamP05555 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgamP05555 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgamP05555 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms