Protein–RNA interactions for Protein: P01849

Tcra, T-cell receptor alpha chain C region, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcraP01849 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TcraP01849 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TcraP01849 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TcraP01849 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TcraP01849 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TcraP01849 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TcraP01849 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TcraP01849 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TcraP01849 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TcraP01849 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TcraP01849 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TcraP01849 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TcraP01849 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TcraP01849 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TcraP01849 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TcraP01849 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TcraP01849 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TcraP01849 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TcraP01849 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TcraP01849 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TcraP01849 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TcraP01849 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TcraP01849 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TcraP01849 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TcraP01849 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TcraP01849 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TcraP01849 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TcraP01849 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TcraP01849 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TcraP01849 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TcraP01849 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TcraP01849 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TcraP01849 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TcraP01849 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TcraP01849 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TcraP01849 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TcraP01849 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TcraP01849 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TcraP01849 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TcraP01849 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TcraP01849 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TcraP01849 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TcraP01849 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TcraP01849 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TcraP01849 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TcraP01849 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TcraP01849 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TcraP01849 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TcraP01849 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TcraP01849 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TcraP01849 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TcraP01849 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TcraP01849 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TcraP01849 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TcraP01849 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TcraP01849 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TcraP01849 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TcraP01849 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TcraP01849 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TcraP01849 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TcraP01849 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TcraP01849 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TcraP01849 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TcraP01849 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TcraP01849 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TcraP01849 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TcraP01849 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TcraP01849 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TcraP01849 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TcraP01849 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TcraP01849 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TcraP01849 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TcraP01849 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TcraP01849 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TcraP01849 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TcraP01849 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TcraP01849 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TcraP01849 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TcraP01849 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TcraP01849 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TcraP01849 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TcraP01849 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TcraP01849 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TcraP01849 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TcraP01849 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TcraP01849 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TcraP01849 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TcraP01849 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TcraP01849 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TcraP01849 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TcraP01849 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TcraP01849 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TcraP01849 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TcraP01849 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TcraP01849 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TcraP01849 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TcraP01849 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TcraP01849 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TcraP01849 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TcraP01849 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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