Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01837 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01837 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01837 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01837 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01837 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01837 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01837 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01837 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01837 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01837 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01837 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01837 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01837 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01837 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01837 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01837 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01837 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01837 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01837 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01837 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01837 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01837 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01837 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01837 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01837 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01837 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01837 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01837 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01837 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01837 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01837 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01837 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01837 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01837 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01837 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01837 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01837 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01837 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01837 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01837 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01837 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01837 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01837 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01837 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01837 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01837 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01837 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01837 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01837 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01837 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01837 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01837 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01837 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01837 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01837 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01837 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01837 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01837 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01837 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01837 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01837 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01837 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01837 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01837 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01837 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01837 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01837 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01837 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01837 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01837 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01837 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01837 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01837 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01837 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01837 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01837 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01837 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01837 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01837 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01837 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01837 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01837 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01837 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01837 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01837 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01837 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01837 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01837 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01837 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01837 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01837 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01837 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01837 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01837 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01837 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01837 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01837 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01837 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01837 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms