Protein–RNA interactions for Protein: P01796

Ig heavy chain V-III region A4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01796 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01796 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01796 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01796 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01796 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01796 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01796 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01796 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01796 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01796 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01796 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01796 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01796 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01796 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01796 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01796 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01796 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01796 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01796 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01796 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01796 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01796 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01796 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01796 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01796 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01796 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01796 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01796 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01796 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01796 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01796 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01796 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01796 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01796 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01796 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01796 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01796 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01796 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01796 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01796 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01796 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01796 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01796 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01796 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01796 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01796 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01796 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01796 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01796 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01796 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01796 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01796 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01796 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01796 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01796 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01796 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01796 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01796 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01796 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01796 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01796 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01796 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01796 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01796 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01796 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01796 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01796 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01796 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01796 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01796 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01796 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01796 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01796 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01796 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01796 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01796 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01796 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01796 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01796 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01796 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01796 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01796 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01796 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01796 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01796 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01796 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01796 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01796 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01796 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01796 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01796 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01796 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01796 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01796 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01796 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01796 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01796 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01796 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01796 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01796 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms