Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01757 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01757 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01757 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01757 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01757 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01757 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01757 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01757 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01757 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01757 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01757 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01757 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01757 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01757 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01757 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01757 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01757 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01757 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01757 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01757 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01757 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01757 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01757 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01757 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01757 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01757 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01757 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01757 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01757 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01757 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01757 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01757 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01757 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01757 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01757 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01757 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01757 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01757 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01757 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01757 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01757 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01757 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01757 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01757 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01757 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01757 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01757 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01757 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01757 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01757 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01757 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01757 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01757 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01757 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01757 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01757 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01757 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01757 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01757 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01757 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01757 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01757 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01757 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01757 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01757 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01757 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01757 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01757 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01757 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01757 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01757 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01757 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01757 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01757 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01757 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01757 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01757 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01757 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01757 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01757 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01757 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01757 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01757 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01757 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01757 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01757 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01757 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01757 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01757 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01757 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01757 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01757 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01757 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01757 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01757 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01757 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01757 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01757 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01757 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.6 ms