Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp1O89090 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp1O89090 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp1O89090 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp1O89090 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp1O89090 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp1O89090 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp1O89090 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp1O89090 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp1O89090 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp1O89090 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp1O89090 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp1O89090 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp1O89090 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms