Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx8O88983 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Stx8O88983 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Stx8O88983 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx8O88983 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx8O88983 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx8O88983 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx8O88983 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Stx8O88983 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx8O88983 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx8O88983 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stx8O88983 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Stx8O88983 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx8O88983 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx8O88983 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms