Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc6O88978 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc6O88978 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc6O88978 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms