Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pak1O88643 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pak1O88643 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pak1O88643 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pak1O88643 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pak1O88643 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pak1O88643 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pak1O88643 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pak1O88643 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pak1O88643 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms