Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IkbkbO88351 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IkbkbO88351 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IkbkbO88351 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IkbkbO88351 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IkbkbO88351 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IkbkbO88351 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IkbkbO88351 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IkbkbO88351 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IkbkbO88351 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IkbkbO88351 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IkbkbO88351 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IkbkbO88351 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IkbkbO88351 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IkbkbO88351 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IkbkbO88351 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IkbkbO88351 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IkbkbO88351 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IkbkbO88351 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IkbkbO88351 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IkbkbO88351 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IkbkbO88351 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms