Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hcn4O70507 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hcn4O70507 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms