Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top3aO70157 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Top3aO70157 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Top3aO70157 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top3aO70157 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top3aO70157 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Top3aO70157 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top3aO70157 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top3aO70157 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top3aO70157 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top3aO70157 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top3aO70157 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms