Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd70O55237 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd70O55237 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd70O55237 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd70O55237 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd70O55237 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd70O55237 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd70O55237 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd70O55237 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cd70O55237 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cd70O55237 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd70O55237 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd70O55237 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd70O55237 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd70O55237 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd70O55237 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd70O55237 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd70O55237 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd70O55237 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd70O55237 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd70O55237 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd70O55237 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd70O55237 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd70O55237 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd70O55237 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd70O55237 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd70O55237 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd70O55237 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd70O55237 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd70O55237 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd70O55237 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd70O55237 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd70O55237 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd70O55237 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd70O55237 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cd70O55237 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cd70O55237 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cd70O55237 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd70O55237 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd70O55237 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd70O55237 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd70O55237 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd70O55237 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd70O55237 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd70O55237 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd70O55237 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd70O55237 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms