Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptpn20O55082 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptpn20O55082 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms