Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Copb2O55029 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Copb2O55029 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Copb2O55029 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Copb2O55029 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Copb2O55029 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Copb2O55029 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copb2O55029 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Copb2O55029 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Copb2O55029 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Copb2O55029 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Copb2O55029 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copb2O55029 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Copb2O55029 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Copb2O55029 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Copb2O55029 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Copb2O55029 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Copb2O55029 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Copb2O55029 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1092.4 ms