Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pole2O54956 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pole2O54956 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pole2O54956 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole2O54956 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole2O54956 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole2O54956 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole2O54956 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms