Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarce1O54941 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarce1O54941 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms