Protein–RNA interactions for Protein: O54834

Arhgap6, Rho GTPase-activating protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap6O54834 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms