Protein–RNA interactions for Protein: O54792

Hes2, Transcription factor HES-2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes2O54792 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hes2O54792 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hes2O54792 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hes2O54792 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hes2O54792 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hes2O54792 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hes2O54792 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hes2O54792 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hes2O54792 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hes2O54792 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hes2O54792 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hes2O54792 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hes2O54792 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hes2O54792 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hes2O54792 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hes2O54792 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hes2O54792 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hes2O54792 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hes2O54792 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hes2O54792 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hes2O54792 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hes2O54792 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hes2O54792 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hes2O54792 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hes2O54792 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hes2O54792 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hes2O54792 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hes2O54792 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hes2O54792 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hes2O54792 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hes2O54792 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hes2O54792 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hes2O54792 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hes2O54792 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hes2O54792 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hes2O54792 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hes2O54792 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hes2O54792 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hes2O54792 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hes2O54792 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hes2O54792 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms