Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CaluO35887 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CaluO35887 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CaluO35887 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CaluO35887 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CaluO35887 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CaluO35887 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CaluO35887 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CaluO35887 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CaluO35887 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CaluO35887 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CaluO35887 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CaluO35887 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CaluO35887 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CaluO35887 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CaluO35887 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CaluO35887 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CaluO35887 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CaluO35887 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CaluO35887 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CaluO35887 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CaluO35887 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CaluO35887 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CaluO35887 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CaluO35887 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CaluO35887 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CaluO35887 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CaluO35887 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CaluO35887 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CaluO35887 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CaluO35887 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CaluO35887 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CaluO35887 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CaluO35887 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CaluO35887 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CaluO35887 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CaluO35887 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CaluO35887 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CaluO35887 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CaluO35887 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CaluO35887 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CaluO35887 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CaluO35887 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CaluO35887 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CaluO35887 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CaluO35887 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CaluO35887 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CaluO35887 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CaluO35887 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CaluO35887 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CaluO35887 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CaluO35887 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CaluO35887 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CaluO35887 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CaluO35887 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CaluO35887 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CaluO35887 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CaluO35887 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CaluO35887 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CaluO35887 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CaluO35887 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CaluO35887 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CaluO35887 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CaluO35887 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CaluO35887 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CaluO35887 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CaluO35887 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CaluO35887 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CaluO35887 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CaluO35887 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CaluO35887 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CaluO35887 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CaluO35887 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CaluO35887 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CaluO35887 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CaluO35887 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CaluO35887 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CaluO35887 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CaluO35887 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CaluO35887 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CaluO35887 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CaluO35887 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CaluO35887 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CaluO35887 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CaluO35887 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CaluO35887 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CaluO35887 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CaluO35887 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CaluO35887 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CaluO35887 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CaluO35887 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CaluO35887 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CaluO35887 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CaluO35887 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CaluO35887 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CaluO35887 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CaluO35887 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CaluO35887 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CaluO35887 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CaluO35887 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms