Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf9O35739 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf9O35739 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf9O35739 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf9O35739 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf9O35739 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf9O35739 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf9O35739 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf9O35739 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf9O35739 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf9O35739 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf9O35739 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf9O35739 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf9O35739 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf9O35739 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf9O35739 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf9O35739 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf9O35739 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf9O35739 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf9O35739 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf9O35739 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf9O35739 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf9O35739 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf9O35739 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf9O35739 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf9O35739 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf9O35739 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf9O35739 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf9O35739 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf9O35739 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf9O35739 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf9O35739 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf9O35739 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klf9O35739 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms