Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccrl2O35457 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccrl2O35457 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms