Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Abcc1O35379 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Abcc1O35379 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Abcc1O35379 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Abcc1O35379 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Abcc1O35379 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Abcc1O35379 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Abcc1O35379 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Abcc1O35379 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Abcc1O35379 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Abcc1O35379 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Abcc1O35379 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Abcc1O35379 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Abcc1O35379 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Abcc1O35379 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Abcc1O35379 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Abcc1O35379 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Abcc1O35379 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Abcc1O35379 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Abcc1O35379 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms