Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kpna3O35344 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna3O35344 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna3O35344 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna3O35344 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna3O35344 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna3O35344 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna3O35344 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna3O35344 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna3O35344 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms