Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema4dO09126 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema4dO09126 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema4dO09126 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema4dO09126 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema4dO09126 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema4dO09126 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema4dO09126 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema4dO09126 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema4dO09126 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema4dO09126 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema4dO09126 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4dO09126 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4dO09126 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4dO09126 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4dO09126 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4dO09126 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4dO09126 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema4dO09126 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sema4dO09126 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms