Protein–RNA interactions for Protein: O08848

Trove2, 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trove2O08848 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trove2O08848 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trove2O08848 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trove2O08848 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trove2O08848 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trove2O08848 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trove2O08848 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trove2O08848 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trove2O08848 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trove2O08848 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trove2O08848 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trove2O08848 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trove2O08848 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trove2O08848 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trove2O08848 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trove2O08848 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trove2O08848 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trove2O08848 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trove2O08848 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trove2O08848 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trove2O08848 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trove2O08848 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trove2O08848 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trove2O08848 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trove2O08848 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trove2O08848 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trove2O08848 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trove2O08848 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trove2O08848 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trove2O08848 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trove2O08848 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trove2O08848 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trove2O08848 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trove2O08848 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trove2O08848 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trove2O08848 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trove2O08848 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trove2O08848 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trove2O08848 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trove2O08848 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trove2O08848 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms