Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gfra2O08842 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gfra2O08842 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms