Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3aO08665 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3aO08665 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms