Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc3aO08576 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc3aO08576 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc3aO08576 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc3aO08576 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc3aO08576 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rundc3aO08576 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc3aO08576 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc3aO08576 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rundc3aO08576 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms