Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp35M0QWN7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp35M0QWN7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp35M0QWN7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp35M0QWN7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp35M0QWN7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp35M0QWN7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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