Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Zfp955bL7N232 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zfp955bL7N232 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp955bL7N232 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp955bL7N232 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp955bL7N232 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp955bL7N232 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms